Структура подразделенного генофонда адыгейцев по данным о двух классах аутосомных ДНК маркерах


Коэффициенты корреляции между результатами анализа



бет2/4
Дата20.05.2020
өлшемі0.92 Mb.
1   2   3   4

Коэффициенты корреляции между результатами анализа

по разным типам генетических маркеров популяций элементарного уровня

Уровень

ЭЛЕМЕНТАРНЫХ ПОПУЛЯЦИЙ

ДНК диаллельные

ДНК мультиаллельные

ДНК (суммарно)

ДНК диаллельные

-

0.13

0.66*

ДНК мультиаллельные

0.12

-

0.79*

ДНК (суммарно)

0.78*

0.72*

-

Число популяций

7

7

7

Число локусов

7

5

12

Примечание: выше диагонали ранговые корреляции по Спирмену, ниже диагонали – по Пирсону. Достоверные значения корреляций (р<0.05) отмечены значком *.
Диаллельные ДНК маркеры. Результаты визуализации генетических расстояний с помощью двух разных методов (многомерного шкалирования и кластерного анализа) и главных компонент (анализ на основе корреляционных матриц) совпали (рис. 3). Они выявили два первичных кластера. В первый вошли элементарные популяции Лазаревского района причерноморских шапсугов - причерноморская 3 и 4. Во второй объединились элементарные популяции прикубанских шапсугов и Туапсинского района причерноморских шапсугов - прикубанская 1, 2, 3 и причерноморская 1, 2. Поскольку прикубанские и причерноморские шапсуги разделены Кавказским хребтом и редко заключают браки друг с другом, то полученный результат плохо согласуется с данными о брачной структуре и истории шапсугов.

Рис. 3. Положение элементарных популяций адыгейцев -шапсугов по семи диаллельным маркерам (АСЕ, PV92, TPA25, FXIIIB, ApoA1, А25, ССR5del32) на графике двумерного шкалирования [число итераций – 218; величина стресса Sо=0,004; коэффициент алиенации Ко=0,007; кривая Шепарда удовлетворительна]. Условные названия: прикубанская 1- это Афипсип; прикубанская 2 - Псейтук; прикубанская 3 - Хаштук+Панахес; причерноморская 1 – Агуй+Псебе; причерноморская 2 – Большое+Малое Псеушхо+Цыпка; причерноморская 3 – .Хаджико+Калеж+Лыготх +Наджиго+ Шхафит; причерноморская 4 – Большой + Малый Кичмай + Головинка +Тхагапш.

Мультиаллельные ДНК маркеры. Кластерный анализ и многомерное шкалирование (рис. 4) выявляют одинаковую закономерность. Все популяции, принадлежащие к прикубанским шапсугам вошли в один кластер: прикубанскяя 1, 2, 3, а все популяции причерноморских шапсугов вошли в другой кластер: причерноморская 1, 2, 3, 4. Причем в этом кластере наиболее генетически близкими оказались географически близкие элементарные популяции Лазаревского района - причерноморская 3 и 4.

Рис. 4. Положение элементарных популяций адыгейцев-шапсугов по пяти мультиаллельным маркерам (D1S80, ApoB, DM, SCA1, DRPLА) на графике двумерного шкалирования [число итераций –50; величина стресса Sо=0,054; коэффициент алиенации Ко=0,095; кривая Шепарда удовлетворительна]. Условные названия: прикубанская 1- это Афипсип; прикубанская 2 - Псейтук; прикубанская 3 - Хаштук+Панахес; причерноморская 1 – Агуй+Псебе; причерноморская 2 – Большое+Малое Псеушхо+Цыпка; причерноморская 3 – .Хаджико+Калеж+Лыготх +Наджиго+ Шхафит; причерноморская 4 – Большой + Малый Кичмай + Головинка +Тхагапш.

Проведен факторный анализ по методу главных компонент: первая компонента описывает 25% общей изменчивости всех мультиаллельных ДНК маркеров, вторая компонента -21%, третья – 18%. Графическое представление элементарных популяций в пространстве первых двух главных компонент представлен на рис. 5 (аналогичный результат получен и в трехмерном пространстве первых трех главных компонент). Выявленная картина соответствует результатам кластерного анализа и многомерного шкалирования.



Рис. 5. Положение элементарных популяций адыгейцев-шапсугов по пяти мультиаллельным локусам (D1S80, ApoB, DM, SCA1, DRPLА) в пространстве двух главных компонент в соответствии с их нагрузкой. Условные названия: прикубанская 1- это Афипсип; прикубанская 2 - Псейтук; прикубанская 3 - Хаштук+Панахес; причерноморская 1 – Агуй+Псебе; причерноморская 2 – Большое+Малое Псеушхо+Цыпка; причерноморская 3 – .Хаджико+Калеж+ Лыготх + Наджиго+ Шхафит; причерноморская 4 – Большой + Малый Кичмай + Головинка + Тхагапш.

Таким образом, на уровне элементарных популяций мультиаллельные ДНК маркеры (107 аллелей 5 локусов) четко выявляют паттерн дифференциации популяции, полностью согласующийся с данными истории, географии и структуры брачных миграций: элементарные популяции подразделились на кластеры причерноморских и прикубанских шапсугов. По диаллельным ДНК маркерам (14 аллелей 7 локусов) полученная картина изменчивости плохо согласуется с данными миграционной структуры популяций.



Видимо, на самом нижнем уровне популяционной системы (уровне элементарных популяций) для достоверного выявления различий между популяциями требуется большее число диаллельных маркеров, чем для выявления различий на более крупном (межплеменном) уровне, где оба класса ДНК маркеров – диаллельных и мультиаллельных – выявляют одну и ту же картину структуры генофонда .
Автор глубоко признателен д.б.н. Е.В. Балановской - рук. лаборатории популяционной генетики человека ГУ МГНЦ РАМН за научное консультирование при выполнении работы и предоставленную возможность генотипирования диаллельных ДНК маркеров; а сотрудникам лаборатории популяционной генетики человека ГУ МГНЦ - М.А. Кузнецовой, Д.С. Соловьевой за помощь в их генотипировании. Автор выражает глубокую благодарность профессору С.А. Лимборской – рук. отдела молекулярных основ генетики человека Института молекулярной генетики РАН и его сотруднику Д.А. Вербенко за предоставленную возможность генотипирования мультиаллельных ДНК маркеров
Работа выполнена при поддержке грантов РФФИ - № 01-04-48243а; № 04-06-80341а, 07–04-00340а, 07-06-00086а, 08-06-00102а и РГНФ - № 07-06-00448а., 07-01-12114в

Каталог: library
library -> Пайдаланушыларға «Виртуалды библиографиялық анықтама» қызмет көрсетудің ережелері
library -> I-бап улыўма режелер q-статья. Усы Нызамны4 ма3сети
library -> Ауыл шаруашылық ғылымдары
library -> А. Ф. Зейнулина филология ғылымдарының кандидаты, профессор
library -> Қазақстан халқы Ассамблеясы
library -> М ж. КӨпеев шығармаларындағы кірме сөздер тарихы оқУ ҚҰралы
library -> Искусный проситель
library -> О профессиональных объединениях аудиторов и аудиторских организаций
library -> Е. Жұматаева жоғары мектепте әдебиетті білімденудің инновациялық технологияларымен оқыту
library -> Іскери – КӘсіби қазақ тілі


Достарыңызбен бөлісу:
1   2   3   4


©netref.ru 2019
әкімшілігінің қараңыз

    Басты бет